同年，周可奇因成绩优异，免试直升武汉音乐学院研究生部，攻读竹笛硕士学位，导师为向思义、胡志平教授。2001年5月，周可奇在武汉编钟音乐厅成功地举办了个人笛子独奏音乐会。并以论文《赵松庭竹笛艺术研究》通过了硕士学位论文答辩，成为我国中南地区首位竹笛硕士。
周可奇的演奏，指法干净，气息流畅，音色醇美而富有激情。他不但研习竹笛，在箫、埙、巴乌、口笛、排箫、葫芦丝等民族吹管乐上均有造诣。2001年4月，由周可奇演奏的《风的回声》（我国著名作曲家刘健作曲），参加英国“2001年科罗伊登音乐节”，获作曲比赛第一名。
周可奇在竹笛理论领域也有研究。2001年，他亲赴杭州采访南派笛子大师赵松庭，在赵松庭先生辞世以前，为竹笛界抢救了一批珍贵的资料，这些都写入了他的论文《赵松庭竹笛艺术研究》中。
近年他参与录制的CD、VCD及电视节目有：
《黄河梁祝》（湖北音像艺术出版社1999年出版发行）
《黑珍珠》（台湾风潮有声出版有限公司2000年出版发行）
《三峡随想》（交响音画 2000年3月20日湖北卫视播放）
《胡志平二胡独奏专辑》（武汉音像出版社2001年出版）
《李协勤笛子作品专辑》（武汉音像出版社2001年出版）
《感悟艺术——竹笛》（谈话类节目 2001年8月4日武汉教育电视台播放）
周可奇近年发表了几万字的竹笛研究论文，其中主要的有
1、至今唯有鹧鸪飞——陆春龄笛曲《鹧鸪飞》赏析
2、散入春城满洛城——唐诗中的笛声
3、竹笛循环换气训练法
4、胡琴琵琶与羌笛——唐代边塞诗中的乐器
5、赵松庭竹笛艺术研究
