通宝口琴属结构比较简单和零件细小的乐器，使用中若不知其结构和原理而精暴的使用，很容易将其损坏。最常见的现象是哑音、沙音、音不准等。
哑音就是吹奏时没有声音。哑音的原因有多种，如口琴簧片被异物卡住，导致簧片不能震动发音，这时可把口琴拆开（有时也拆开），将杂物消除便可。还有一个原因是吹奏者唾沫过多，导致吹孔被淤塞。簧片被唾液粘住而不能正常震动，解决的办法是将口琴孔向下，用力把水分从口琴内拍出，拍击时可用一餐巾纸或手绢放在另一手掌心，然后在上面拍打，问题即可解决。
产生沙音的原因大多是使用者不小心将口琴跌落或用水猛烈冲洗等，致使簧片变位或变形，吹奏时簧片边缘与固定簧片的基座发生磨擦而产生沙音。遇到这种情况，可将口琴完全拆开，把发沙音的簧片拨正或拨平，使簧片不磨擦基座的孔眼边缘，沙音也就消除了。
口琴经过一段时间的使用，有的音就会出现变音现象。修理的方法是，先把口琴拆开，用锉刀对簧片进行修理，簧片发音偏低时，用锉刀锉掉簧片的头部少许便可，基发音偏高，就锉簧片的根部。注意，不管偏高或偏低，都不要锉得太多，以免影响整体音色。
